Следующим обострением обстановки на Физулинском направлении стали бои летом 1993 года.
Первые позиционные атаки на Физулинском направлении армянские войска начали еще в июле 1993 года. В ходе этих атак они прощупывали линию обороны наших войск и искали слабые места для нанесения основного удара. Так, в ходе атаки 2-4 июля были оккупированы села Арыш, Гочахмедлы, Гараджалы, Хатынбулаг и Горазыллы Физулинского района, а 15 июля 1993 года в ходе атаки было захвачено село Джуварлы Физулинского района. В ходе контратак азербайджанские войска выбили армянские войска из этих сел. Эти атаки армянских войск, кроме прощупывания линии обороны азербайджанской армии на Физулинском направлении, также преследовали цель сковывания азербайджанских войск и исключения возможности переброски резервов в Агдамский район, где шли основные бои.
После захвата Агдама и перегруппировки своих войск, сконцентрировав основные свои силы в Гадрутском и Ходжавендском районах, 04 августа 1993 года, армянские войска после сильной артподготовки, начали массированное наступление на Физули и Джебраил. В наступлении участвовали войска Гадрутского оборонительного района под командованием Артура Агабекяна и войска Мартунинского оборонительного района (после смерти М.Мелконяна он был разделен на две части под командованием Мовсеса Акопяна и Нельсона Согомоняна). С самого начала наступления, армянское командование завладело инициативой и навязало наши войскам свой ритм и темп боевых действий. Основные удары наносились в направлении сел Каджар-Юхары Яглавенд и Эдилли - Ахуллу Физулинского района. Таким образом, армяне повторяли свою тактику, использованную при захвате Агдама: фланговыми ударами в обход Физули с юга и севера, прорвать фронт в нескольких местах, расчленить азербайджанские войска, окружить Физули и выйти на оперативный простор. К началу августа 1993 года, армянским войскам удалось вклиниться в оборону азербайджанской армии в Физулинском районе на 10-15 км. Им удалось захватить села Каджар, Юхары Яглавенд, Ашагы Вейсалли, Эдилли, Ахуллу, Кочахмедли и перерезать дорогу Физули-Джебраиль. 8-9 августа 1993 года, наши войска предприняли контрнаступление в ходе которого им удалось отбросить армянские войска на 5-10 км от Физули и вернуть под свой контроль село Каджар и Юхары Яглавенд.
К сожалению, борьба за власть не обошла и сам Физулинский район. Даже в условиях массированного наступления армян, угрозы оккупации Физули, сами жители Физулинского района не смогли удержаться от борьбы за власть и хотя бы на время армянского наступления объединиться для защиты города. В середине августа 1993 года группа вооружённых людей во главе с неким лицом по кличке «Японец», свергла главу исполнительной власти Физулинского района и захватив здание администрации района провозгласила главой исполнительной власти Физулинского района Казыма Ибишова. Т.е. с одной стороны шло наступление армян на Физули, а с другой стороны в самом Физули шла яростная борьба за власть.
Этой темы в своем выступлении 23 августа 1993 года коснулся и Г.Алиев: «Вернувшиеся оттуда этой же ночью наши должностные лица проинформировали меня, что в Джабраильском районе сеют панику среди населения, занимаются провокациями исключительно тамошний глава Исполнительной власти и недостойные люди из его окружения. Это люди, которые готовы для достижения личных целей, претворения в жизнь своих грязных интересов ввергнуть в несчастья и народ, разорить и землю, и край предков, где они живут. Оттуда мне докладывают, что какой-то батальон не хочет воевать, потому что это батальон какого-то Алисоя, Народного фронта; про второй батальон говорят, что это батальон Рагима Газиева, тоже воевать не хочет; другой батальон принадлежит еще кому-то, воевать не желает. Все разбежались по сторонам и эти безоружные, не готовые к войне граждане, конечно же, не хотят покидать Родину, не хотят покидать свои дома, но в результате провокации руководителей, они впадают в панику и бегут. Подобное было и в Физулинском районе. Прежний тамошний глава Исполнительной власти ушел, после же, во время этих процессов, кем-то, какими-то силами, якобы какими-то военными частями туда был поставлен глава Исполнительной власти, который тоже занимался очень грязными делами, что также крайне осложнило ситуацию в Физулинском и Джабраильском районах.»
На Физулинском направлении, несмотря на потери, армяне продолжали рваться к Физули, нанося основные удары с территории Гадрутского и Ходжавендского района. 15 августа 1993 года, в ходе очередного наступления, армянским войскам удалось прорвать оборону наших войск и вновь захватить села Каджар и Юхары Яглавянд, а также села Каргабазар, Ишыглы, Девлеярлы. 16 августа также было оккупировано село Заргяр. 18 августа 1993 года, после ожесточенных боев армянские войска захватили важные высоты Менгелената и Бахтыч, расположенные вокруг г.Физули. 19 августа 1993 обойдя город с севера и юга и захватив село Юхары Аибасанлы армянским войскам удалось замкнуть кольцо вокруг Физули. С 20 по 22 августа 1993 года армянские войска несколько раз атаковали г.Физули, даже несколько раз передавали сообщение о падении города, но взять город так и не смогли. Несколько дней наши войска удерживали окруженный город, после чего в ночь с 22 на 23 августа прорвались из города в восточном направлении. В этот же день г.Физули был захвачен армянскими войсками.
К сожалению падение Физули привело почти к развалу фронта и панике на линии фронта. Отступавшие из Физули азербайджанские войска на смогли закрепиться на позициях около города и отошли от города на 10-20 км. После захвата города армянские войска продолжили наступление и 24 августа 1993 года захватили село Гараханбейли. Азербайджанские войска отошли на линию Алаханлы - Ашагы Сеидахмедли – Ашагы Абруахманлы – Горадиз – Куйджак.
24 августа 1993 года Гейдар Алиев прокомментировал бои в Физулинском и Джебраильском районах:«В последнее время в Физулинском и Джебраильском районах сложилась крайне тяжелая обстановка. Вчера в своем обращении к народу я коротко рассказал об этом. Мы, можно сказать, днем и ночью занимаемся этими вопросами, предпринимаем все возможные меры. Сейчас я хочу подробнее остановиться на ситуации. К сожалению, сообщения, поступившие вчера и позавчера из Физули и Джебраила, свидетельствуют в первую очередь о том, что земли были проданы отдельными мафиозными структурами и главами исполнительной власти этих районов. Они и связанные с ними лица, а также некоторые лица из воинской части запугивают народ, заставляют жителей бежать, занимаются грабежом и сами исчезают, в то время как со стороны вооруженных армянских формирований не наблюдается никаких наступлений.
Однако вызывает сожаление то, что наши части уходят из мест, подвергшихся наступлению, уходят разрозненно, не оказывают достойного сопротивления, не сражаются. Вчера, например, мы связывались и с Москвой, и с Ереваном, наши представители связывались с Ханкенди. Как нам сообщили из районов, о которых выше шла речь, убежали и военные, и жители. В населенном пункте Гараханбейли Физулинского района разведывательная группа армян обнаружила брошенные неповрежденный танк, две единицы боевой техники, две - три машины. Никого не обнаружив, армяне погрузили всю технику на машины и перевезли на свою территорию.
Смотрите, я рассказал только об одном факте. Я не хотел открыто говорить об этом. Потому что, как мне кажется, население не должно обо всем этом знать. Но нам известно о большинстве подобных фактов. Сложилась очень тяжелая ситуация, и я об этом говорил вчера. Один служит у Рагима Газиева, другой - в батальоне Алисоя, третий подчиняется Народному фронту, четвертый-Аликраму Гумбатову, пятый - еще кому-то. Отсюда - диверсия за диверсией. Нашему народу, народу Азербайджана испокон веков были присущи высокие моральные качества. Это и сейчас так. Я не могу обвинить в диверсиях весь народ. Но предательство, продажность, недостойное поведение отдельных азербайджанцев в таких масштабах разрывают сердце, приводят в ужас. Посмотрите, ведь мы запятнали себя не только потому, что наши земли захвачены. Но и потому, что армяне, пришедшие как агрессоры на нашу землю, говорят, что «Ваши люди убегают до нашего прихода». Это говорят они.»